Logo Nilaiku dirancang dengan gaya yang sederhana namun tegas, menampilkan garis bersih dan warna alami yang merepresentasikan keterhubungan langsung antara petani, nelayan, dan konsumen. Bentuk persegi enam menjadi simbol utama, melambangkan keseimbangan dan kekuatan kolektif, seperti struktur sarang lebah—menggambarkan bahwa semua elemen dalam rantai pangan saling terhubung dan bekerja bersama dalam satu ekosistem digital. Warna hijau melambangkan daratan subur tempat para petani menanam harapan, sementara garis biru melambangkan laut, membuka ruang bagi nelayan dan hasil laut lokal untuk ikut tumbuh bersama.

Tunas muda di bagian atas logo menjadi simbol era baru bagi pertanian dan perikanan Indonesia—era di mana mereka tumbuh bersama teknologi dan pemasaran digital yang terpadu. Logo ini bukan sekadar identitas visual, tetapi juga cerminan misi Nilaiku: mewadahi pertumbuhan pelaku pangan lokal dalam satu platform yang adil, transparan, dan inklusif, baik di darat maupun di laut.